重金属的污染是另一个问题，像铅、铜、汞等等，对健康都有长期的危害。以美国的切斯比克湾为例，汞的污染日益严重，在鱼体内大量沉积，鱼类甚至因为污染出现变性，造成有关卫生部门从呼吁多吃鱼以增进健康改为每周最多吃两次鱼以预防污染。水源的污染是全球性的问题，是工业文明的一个严重的后果。水源的污染对人体的危害，除了由细菌引起的急性的发作外，还有就是化学和重金属污染这种慢性的发作。化学和重金属污染是一个堆积的过程，喝得越多就越严重，因此提倡多喝水的时候一定要注意水源的污染现象。
喝瓶装水现在蔚然成风，成为受教育人群重视健康的标志，在很多人眼里，瓶装水既卫生又健康。瓶装水从单位量上算比汽油还贵，成为石油公司乱涨价的一个借口。但是，瓶装水并不能逃脱被污染的命运。不管是从哪里取的水，怎么处理的，由于瓶装水基本上不采取消毒措施，里面一样含有低于标准的细菌和可能的污染，所以说瓶装水从健康的角度并没有比自来水好多少。唯一有益的是瓶装水里面的钙和镁等矿物质可能对预防心脏病有好处。
如此说来，是不是应该喝矿泉水，而且矿物质含量越高越好？这里又回到预防污染的前提上了，矿物质高的水，除了有利于健康的成分以外，里面的其他杂物也多，人体需要矿物质，但也可以通过其他途径补充，从水里补充的话，在水质好的情况下，比如从高山的泉眼里取水，是一个很好的办法。可是现在污染非常严重，人类的活动范围也日益扩大，几乎不存在世外桃源，所谓的矿泉也都被污染了，何况所谓的矿泉水是否真的取自泉水也值得怀疑，借喝矿泉水补矿物质是一个非常不智的方法，对健康是不利的。矿泉水喝多了，微量元素有可能过多，多了就会在血流、细胞内沉积，导致微量元素代谢失调，增加肾脏负担，易产生肾结石、尿道结石及胆结石等，微量元素的中毒比缺乏要严重得多，而且两者在浓度上很接近，稍稍多一点就属于中毒。由于喝水是经常性的，所以长期饮用矿泉水的人，微量元素中毒的可能性很大。不仅不应该喝高矿物质含量的水，而要尽可能喝纯水。
